Международный центр вакцинологии КазНАУ совместно с партнерами – Национальным научным центром особо опасных инфекций им. М. Айкимбаева и генетической лаборатории TreeGene, на платформе GISAID (Глобальная инициатива по обмену данными по гриппу) опубликовали генетическую последовательность Spike-белка вируса SARS-CoV-2, выделенных из образцов трех пациентов. Об этом событиии на своей странице FaceBook сообщил профессор Казахского национального аграрного университета (КазНАУ) системы НАНОЦ МСХ РК, проректор КазНАУ, директор Международного центра вакцинологии при КазНАУ Кайсар Табынов. 

В качестве исследовательских образцов использовались один оригинальный материал от переболевшего пациента, а также два выделенных вируса SARS-CoV-2 . Примечательным является то, что впервые в мире секвенирован ген вируса SARS-CoV-2 , выделенного из 10-суточных куриных эмбрионах.

Spike-белок находится на внешней оболочке вируса, образуя белковые шипы. Он взаимодействует с клеточным рецептором ACE2 и участвует в проникновении патогена в клетки человека.

Цель данной работы заключалась в установлении генетической последовательности и мутаций штаммов вируса SARS-CoV-2  (по аминокислоте в 614 позиции Spike-белка), которые будут использоваться в оценке протективности разрабатываемой отечественной коронавирусной вакцины на различных лабораторных животных. Исследования в этом направлении продолжаются. Планируется провести полногеномное секвенирование этих, а также десятка других вирусов COVID-19, циркулирующих в Казахстане. 

Для справки: представленные генетические последовательности на сегодня являются единственными из г. Алматы, остальная львиная доля (более 50-ти) приходится на г. Нур-Султан (НЦБ и НЦЭ).

Напомним, что Глобальная инициатива по обмену данными о птичьем гриппе (GISAID) была основана в 2006 году, но с декабря 2019 года также стала базой для коронавируса SARS-CoV-2. С момента своего запуска GISAID играет важную роль в обмене данными между сотрудничающими центрами ВОЗ и национальными центрами по гриппу в отношении рекомендаций Глобальной системы ВОЗ по эпиднадзору за гриппом и ответным действиям (GISRS) по рекомендациям в отношении штаммового состава вакцин против вируса гриппа.

Инициатива GISAID способствует быстрому обмену данными обо всех вирусах гриппа и коронавирусе, вызывающем COVID-19. Она содержит подборку генетических последовательностей полных и частичных геномов коронавируса SARS-CoV-2, предоставленных клиницистами и исследователями из разных стран. Помимо этого, в ней аккумулированы клинические и эпидемиологические данные, связанные с вирусами человека, а также географические и видоспецифичные сведения, связанные с вирусами птиц и других животных, чтобы помочь исследователям понять, как вирусы развиваются и распространяются во время эпидемий и пандемий.